巴氏殺菌機的物料在連續流動的狀態下通過套管式熱交換器加熱至138～150℃，并在這一溫度下保持一定的時間(2～4秒)以達到商業無菌水平，然后在無菌狀態下無菌環境中灌裝于無菌包裝容器中。整個滅菌過程在高溫狀態下瞬時內完成，將能引起物料腐敗和變質的微生物和芽孢徹底殺滅，同時，極大的保存了食品原有的風味和營養成分。這種嚴格的加工工藝和設備精確的處理方法有效地防止了食品的二次污染，大大延長了產品的保質期。UHT工藝優選采用直列套管式換熱器殺菌系統，因其在較高蒸汽壓力及超高溫狀態下所具備的可靠工作性能，尤其連續工作時間可長達十多個小時，從而獲得了比板式殺菌系統更為廣泛的應用。

  巴氏殺菌機是是將溫度控制儀設定好PU值給轉化為各溫區水槽的實際控制溫度的曲線，在通過對于溫度的檢測精確的控制各溫區的溫度的變化。主傳動電機帶動上下兩層的輸瓶鏈網將物料一次的經過三個溫區的逐級的升溫預熱，和兩個溫區的殺菌以及三個溫區的逐級的降溫和冷卻的過程。

  巴氏殺菌機不斷發展的過程中一些技術也在不斷進步，加熱降溫原理有壓縮機和水循環兩種，相比之下水循環要比壓縮機的效率高，且保留了牛奶的原味，逐步替代了壓縮機殺菌機，水循環殺菌機的類別在市面上有迷你型、簡易型、豪華型、柜式、酸奶鮮奶一體機等種類，隨著巴氏殺菌工藝的不斷發展，殺菌機的種類也在不斷的增加。

  要為牛奶的一種滅菌法，既可殺死對健康有害的病原菌又可使乳質盡量少發生變化。